该公司回购股票时的分录：
借：库存股(每股回购价×回购股数)   6000000
    贷：银行存款   6000000
注销库存股时的分录：
借：股本    2000000
    资本公积—股本溢价  4000000
    贷：库存股    6000000
回购价款大于股本的金额，资本公积足够冲减，因此不再冲减盈余公积。