认知行为理论存在一定的限制，主要表现在：①认知行为理论认为，个人的心理功能是认知、行为和环境之间交互作用的结果，而三者的交互作用的关系是非常复杂的，在助人实践中很难明确分清三者的不同作用；②认知行为理论对个体的认知能力有较高的依赖，所以在面对缺乏足够认知能力的个体时，其适应性就受到很大限制；③认知行为的使用者需要较为专业系统的训练，不易为一般工作者掌握，其应用范围受到限制；④在应用认知行为理论的过程中，应该警醒该理论更多地聚焦于个体的心理和行为。